Prema Pravilima Šumarskog fakulteta organi upravljanja, nadzora i rukovođenja su: Upravni odbor, Nastavno-naučno vijeće, Dekan i Nadzorni odbor.

UPRAVNI ODBOR
Upravni odbor je organ upravljanja Fakulteta. Ima pet članova koje imenuje Vlada Kantona Sarajevo. Vlada imenuje dva člana Upravnog odbora iz reda nastavnika Fakulteta, na prijedlog Nastavno-naučnog vijeća.

Upravni odbor Fakulteta čine:

Suad Skejović, dipl. inž. građevine, predsjednik
prof. dr. Ahmed Smajić, član
prof. dr. Ramiz Ćutuk, član
prof. dr. Sead Vojniković, član i
doc. dr. Azra Čabaravdić, član.

NASTAVNO-NAUČNO VIJEĆE
Nastavno-naučno vijeće je stručni organ Fakulteta kojeg sačinjavaju svi nastavnici i pet predstavnika asistenata. Aktuelno Nastavno-naučno vijeće ima 22 člana.

DEKAN
Organ rukovođenja na Fakultetu je dekan. Dekan se imenuje iz reda nastavnika u zvanjima redovni ili vanredni profesor. Imenuje ga i razrješava Upravni odbor Fakulteta.

Dekan Fakulteta u mandatu 2008-2012 je prof. dr. Faruk Mekić

Na prijedlog Dekana, Upravni odbor imenuje tri prodekana. Aktuelni prodekani su:

Prodekan za nastavu, prof. dr. Dalibor Ballian
Prodekan za NIR i finansije, prof. dr. Mersudin Avdibegović i
Prodekan za međunarodnu saradnju, prof. dr. Tarik Treštić

NADZORNI ODBOR
Ovaj odbor vrši analizu izvještaja o poslovanju i nadzor nad upotrebom sredstava za rad. Ima tri člana koje imenuje Vlada Kantona Sarajevo. Najmanje jedan član ovog odbora je iz reda nastavnika i viših asistenata Fakulteta.

Nadzorni odbor Fakulteta čine:

mr. Samir Fazlić, predsjednik
Selver Vreto, dipl. inž. poljoprivrede, član
prof. dr. Ćemal Višnjić, član